一般感染的诊断是要依据病史和临床上的表现而确定的。如果存在不洁的性交史，并且在生殖器部位出现了皮肤红斑和原发性的水疱，这种很容易出现复发并不会太难的诊断。并且在必要的时侯可作疱液涂片，培养、接种、免疫荧光等检查。血清免疫抗体测定等，都是有利于诊断和确定病毒的类型的。
1、细胞学方法
可以对皮损的刮片做Wright-Gemsa (Tzanck试验)或Papanicolaou染色，这样可以检出HSV感染特征的巨细胞包函体，但通常不能区别HSV感染或是水痘 — 带状疱疹病毒感染，敏感性仅为病毒分离的60%。
2、培养法
可以从水疱底部取材做组织培养分离病毒，这是目前比较敏感、#特异的检查方法，一般需5到10天，因为技术条件要求高，价格会比较贵，所以不能普遍使用。
3、抗体检测
现在#广泛的是HSV-2抗体检测，比如蛋白印迹法也可用gD2作抗原检测HSV-2抗体，具有敏感性，且能区分HSV-1和HSV-2的优点。
4、基因诊断
通常是用PCR分型检测单纯疱疹病毒
